Το Yu-Gi-Oh Master Duel εφαρμόζει σημαντικές αλλαγές στο σύστημα crafting, περιορίζοντας εκμετάλλευση που επέτρεπε στους παίκτες να αποσπούν πλήρη ανταμοιβή από κάρτες που μόλις απαγορεύτηκαν. Οι νέοι κανόνες ισχύουν από 25 Ιουλίου, ενώ προστίθενται νέα πακέτα και δυνατά archetypes στο παιχνίδι.