Φημολογείται ότι ένα νέο παιχνίδι Prototype μπορεί να είναι υπό ανάπτυξη, με τον Άλεξ Μέρσερ και έναν ανοιχτό κόσμο στη Νέα Υόρκη. Ωστόσο, οι φήμες για το Prototype 3 πρέπει να ληφθούν με επιφυλακτικότητα, καθώς έχουν περάσει 13 χρόνια από την κυκλοφορία του Prototype 2 και η ζήτηση μπορεί να μην είναι αρκετή για να δικαιολογήσει την ύπαξή του.