Το S.T.A.L.K.E.R.: Clear Sky είναι το πρώτο χρονολογικά παιχνίδι της σειράς S.T.A.L.K.E.R. με βελτιώσεις στην τεχνολογία και τα γραφικά. Εισάγει το σύστημα Πολέμου Φaction, όπου οι παίκτες επιλέγουν πλευρές, επηρεάζοντας τις σχέσεις με άλλες φατρίες. Οι παίκτες μπορούν να ζήσουν διαφορετικές εμπειρίες σε δύο αναπαραγωγές.