Τα mods του Cities Skylines βελτιώνουν σημαντικά το παιχνίδι, προσφέροντας εργαλεία για διαχείριση κυκλοφορίας, επέκταση χαρτών, αισθητικές παρεμβάσεις και ρεαλιστικότερη προσομοίωση. Παρά τα προβλήματα του sequel, το αρχικό παιχνίδι παραμένει κορυφαίο χάρη στη μεγάλη ποικιλία καινοτόμων mods που διευκολύνουν και εμπλουτίζουν την εμπειρία.